“Rodovírus” ou “Caronavírus”? Mapas da Distribuição do Covid-19 na Região Sul do Brasil: Indícios da contaminação por rodovias
subject: planning, contamination, mapping, coronavirus, highways
description: Covid-19 is an infectious disease caused by a coronavirus. In Brazil, the first cases arrived via the airports of the city of São Paulo and spread throughout the country. In this paper maps of the Southern region allow the visualization of COVID-19 cases by municipality, cumulative cases, cumulative deaths, incidence rate of cases per 100,000 inhabitants (relationship between cases and population of the municipality) and the case-fatality rate (relationship between the number of deaths and the number of people infected). The maps indicate that the highest concentrations occur on a few sections of the road network, mainly along the BR-386 motorway, which connects Carazinho - RS to Porto Alegre - RS, of the Freeway motorway, which connects the capital from the State to the beaches, and BR-101, one of the most important of the north-south link. Although not conclusive, the diagrams presented can be used to plan emergency actions for the disease.
creator: Paulo Eduardo Angelin, Ricardo R. Monteiro, Rangel Angelotti, Luiz Fernando de Carli Lautert, João Portes
source: Confins
publisher: Confins
date: 2020
identifier: DOI: 10.4000/confins.28246
coverage: Geography. Anthropology. Recreation

Could human coronavirus OC43 have co-evolved with early humans?
subject: codon usage, coronavirus, spillover, coevolution
description: Abstract This paper reports on an investigation of the role of codon usage evolution on the suggested bovine-to-human spillover of Bovine coronavirus (BCoV), an enteric/respiratory virus of cattle, resulting in the emergence of the exclusively respiratory Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43). Analyses based on full genomes of BCoV and HCoV-OC43 and on both human and bovine mRNAs sequences of cholecystokinin (CCK) and surfactant protein 1 A (SFTP1-A), representing the enteric and respiratory tract codon usage, respectively, have shown natural selection leading to optimization or deoptimization of viral codon usage to the human enteric and respiratory tracts depending on the virus genes under consideration. A higher correlation was found for the nucleotide distance at the 3rd nucleotide position of codons and codon usage optimization to the human respiratory tract when BCoV and HCoV-OC43 were compared. An MCC tree based on relative synonymous codon usage (RSCU) data integrating data from both viruses and hosts into a same analysis indicated three putative host/virus contact dates ranging from 1.54E8 to 2.44E5 years ago, suggesting that an ancestor coronavirus might have followed human evolution.
creator: Paulo Eduardo Brandão
source: Genetics and Molecular Biology
publisher: Sociedade Brasileira de Genética
date: 2018
language: EN
identifier: DOI: 10.1590/1678-4685-gmb-2017-0192
coverage: Genetics

Soroprevalência de anticorpos anti-rotavírus do sorogrupo A em bovinos de uma fronteira pioneira na Amazônia brasileira
subject: Estudos Soroepidemiológicos, anticorpos, rotavirus, bovinos, Amazônia
description: O rotavírus é um agente etiológico de diarréias de distribuição mundial, responsável por grandes prejuízos econômicos. Pesquisou-se a soroprevalência de anticorpos anti-rotavírus do sorogrupo A em bovinos criados no município de Uruará, utilizando a técnica da contraimunoeletroosmofore com a amostra NCDV como antígeno padrão. A prevalência de propriedades positivas foi de 95.6-100%. Diferenças significativas foram observadas entre as sucessivas faixas etárias, quando a soropositividade aumentou dos grupos mais jovens para os mais velhos, bem como entre fêmeas e machos maiores de 1 ano, quando a soropositividade foi maior no primeiro grupo.
creator: Paulo Eduardo Brandão, Adriana Cortez, Fernando Ferreira, José Soares Ferreira Neto, Fabio Gregori, Marcos Bryan Heinemann, Valéria Stacchini Ferreira Homem, Cesar Alejandro Rosales Rodriguez, José Antonio Jerez
source: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
publisher: Universidade de São Paulo
date: 2002
language: EN, PT
identifier: DOI: 10.1590/S1413-95962002000100003
coverage: Animal culture

Sobre a evolução do vírus da bronquite infecciosa das galinhas em células VERO
subject: IBV, Espícula, evolução, in vitro
description: O vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) (Nidovirales: Coronaviridae) é um Gammacoronavirus com a maior taxa evolutiva no gênero e, apesar de uma recentemente relatada atividade corretiva de sua polimerase, a diversidade intra e inter-hospedeiros é um fenômeno bem documentado. Este estudo objetivou avaliar a variação genética após passagens seriais de uma amostra de IBV variante. A amostra CRG-BETA, propagada em embriões de galinhas, foi inoculada em monocamadas de células VERO até a quarta passagem e cada passagem foi monitorada com uma RTPCR para a região S1 do gene S (nt 705 a 1094) e uma RT-PCR para o mRNA da proteína 5a do vírus. Todas as passagens foram positivas para S1 e as passagens 1 a 3 para mRNA 5a; sequências de S1 não apresentaram polimorfismos. O encontro de mRNA de IBV nos cultivos celulares demonstra que a amostra CRG-BETA está replicando nas células VERO e, em relação à análise de S1, a ausência de mutações de nucleotídeos demonstra que a amostra CRG-BETA pode ter atingido um estado fixo. Como conclusão, diferentes genótipos de IBV apresentam diferentes padrões evolutivos não apenas in vivo, como previamente conhecido, mas também in vitro, como aqui relatado.
creator: Paulo Eduardo Brandão, Leonardo José Richtzenhain, Laura Yaneth Villarreal Buitrago
source: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
publisher: Universidade de São Paulo
date: 2012
language: EN, PT
identifier: DOI: 10.11606/issn.2318-3659.v49i5p386-390
coverage: Animal culture

Disposição espacial e injúrias da lagarta-do-cartucho Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) em milho
subject: Ecología espacial, amostragem, dispersão, ecologia populacional, zea mays
description: O conhecimento dos padrões de dispersão populacional de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith), a mais importante praga do milho, no Brasil, é fundamental para o estabelecimento de técnicas eficientes de monitoramento e manejo. Este trabalho objetivou conhecer a distribuição espacial da praga na cultura. A distribuição espacial foi avaliada em cinco campos experimentais, de um hectare cada, divididos em 100 unidades experimentais, onde se avaliaram de cinco a dez plantas por parcela. Foi testado o ajuste das frequências observadas às esperadas, de acordo com as distribuições de Poisson, Binomial Negativa e Binomial Positiva. Spodoptera frugiperda ocorreu em elevados índices populacionais na área amostral, com correlação significativa entre a nota de injúria 3 e o número de lagartas médias, o que também ocorreu para o número de plantas infestadas com pelo menos uma lagarta média. Não houve correlação significativa entre a nota de injúria 3 e lagartas pequenas. O modelo que melhor se aproximou dos dados de distribuição da oviposição foi a Binomial Positiva, enquanto a disposição espacial de lagartas, atacando a espiga, foi descrita como aleatória. O modelo de distribuição Binomial Positiva foi o que melhor representou a distribuição espacial da população de plantas infestadas; a distribuição das lagartas de tamanho médio teve padrão de distribuição agregada.
creator: Paulo Eduardo Degrande, Renato Suekane, Elmo Pontes de Melo, Izidro dos Santos de Lima Junior, Cássio Kodama, Marcos Gino Fernandes
source: Revista Ceres
publisher: Universidade Federal de Viçosa
date: 2014
relation: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-737X2014000300007&lng=en&tlng=en
coverage: Agriculture (General), Biotechnology

Embates em torno da segurança e soberania alimentar: estudo de perspectivas concorrentes
subject: Segurança alimentar. Agricultura familiar. Desenvolvimento rural. Multifuncionalidade. Sustentabilidade da agricultura
description: A propagação da noção de soberania alimentar nos últimos anos leva a pensar nos pontos de vista em jogo no campo de debate sobre os problemas alimentares. Deste modo, é possível identificar que a polissemia em torno da noção de segurança alimentar deixa margem para ambivalências, o que provoca descontentamentos. É nestas circunstâncias que a defesa da soberania alimentar ganha terreno, noção favorável à diversidade das agriculturas do mundo e propícia ao reconhecimento de seus múltiplos papéis. Aqui, trata-se de uma releitura da evolução dos sentidos e das concorrências em torno da segurança alimentar a fim de evidenciar as razões que conduzem a construção da noção de soberania alimentar. Ademais, as estratégias de agricultores familiares brasileiros são examinadas em termos de perspectivas de soberania alimentar.
creator: Paulo Eduardo Moruzzi Marques
source: Revista Segurança Alimentar e Nutricional
publisher: Universidade Estadual de Campinas
date: 2015
relation: https://periodicos.sbu.unicamp.br/ojs/index.php/san/article/view/8634795
coverage: Agriculture (General), Nutrition. Foods and food supply

Locavorismo: uma análise de suas contradições à luz de experiências de agricultura urbana em São Paulo
subject: Agricultura urbana, Ativismo alimentar, Locavorismo
description: RESUMO Este artigo tem por objetivo explorar conceitualmente o movimento de ativismo alimentar chamado “locavorismo”, contextualizando seu surgimento e algumas de suas manifestações. Ao ser colocado em prática, o locavorismo pode ter efeitos diversos e até mesmo antagônicos. Para que fossem analisadas essas contradições, foram entrevistadas duas organizações de agricultores na cidade de São Paulo inseridas em circuitos de consumo local para que se fizessem compreender na prática os potenciais efeitos sociais e ambientais deste tipo de compra.
creator: Paulo Eduardo Moruzzi Marques, Manuela Maluf Santos
source: Estudos Avançados
publisher: Universidade de São Paulo
date: 2021
relation: http://www.scielo.br/pdf/ea/v35n101/1806-9592-ea-35-101-257.pdf
coverage: Social sciences (General)

A participação da agricultura familiar no Programa Nacional de Alimentação Escolar: estudo de casos em municípios paulistas da região administrativa de Campinas
subject: Alimentação escolar. Agricultura familiar. Desenvolvimento local sustentável. Segurança alimentar. Políticas públicas. Circuitos curtos de proximidade
description: A participação da agricultura familiar no Programa Nacional de Alimentação Escolar (PNAE) constitui a questão chave deste artigo. Nesta perspectiva, nosso estudo se dirigiu à discussão sobre o funcionamento dos conselhos municipais de alimentação escolar (CAE) de Americana, Cosmópolis e Piracicaba. Trata-se de uma análise sobre as compras de produtos da agricultura familiar, interrogando em que medida o Programa Nacional de Alimentação Escolar é considerado como um meio para promover o desenvolvimento local com ênfase no fortalecimento dos agricultores familiares. O conceito de referencial de circuitos curtos de proximidade, vinculado à sustentabilidade agroalimentar, foi considerado em nossa análise. Foram entrevistados, em 2015 e 2016, atores chave do programa nos municípios escolhidos. Nossa pesquisa permitiu constatar que todas as prefeituras estudadas realizam compras de produtos da agricultura familiar. Porém, o fomento ao desenvolvimento local está longe de alcançar o que é recomendado nos documentos do PNAE. Para atingir o mínimo de 30% dos recursos do Fundo Nacional de Desenvolvimento da Educação (FNDE) transferidos para os municípios para a aquisição de gêneros alimentícios advindos da agricultura familiar, as prefeituras consideradas recorrem frequentemente a organizações distantes de agricultores familiares.
creator: Paulo Eduardo Moruzzi Marques, Morgane Isabelle Hélène Retière, Nayla Almeida, Carolina Ferraz dos Santos
source: Revista Segurança Alimentar e Nutricional
publisher: Universidade Estadual de Campinas
date: 2017
relation: https://periodicos.sbu.unicamp.br/ojs/index.php/san/article/view/8649835
coverage: Agriculture (General), Nutrition. Foods and food supply

Justiça ecológica como bússola para ações em favor da agricultura urbana e periurbana
subject: Desenvolvimento Territorial, circuitos curtos alimentares, produção alimentar local, sustentabilidade, teoria das justificações
description: Resumo: Este artigo explora a teoria das justificações para a análise das motivações e estratégias de atores da Agricultura Urbana e Periurbana (AUP) no estado de São Paulo, considerando perspectivas de desenvolvimento de seus territórios. Com uma abordagem cruzando sociologia e geografia, a pesquisa que ofereceu elementos de análise para a elaboração deste artigo fundamentou-se em entrevistas semiestruturadas, observações de campo e análise documental, considerando os casos do assentamento Milton Santos, situado parte em Americana, parte em Cosmópolis, assim como da Associação de Agricultores da Zona Leste da capital. O direito de acesso ao fundiário é absolutamente central para a AUP. A reivindicação deste direito, bem como a concepção de papéis das atividades compreendidas pela AUP, mobilizam referências de justiça com contornos ecológicos, o que oferece crescente legitimidade à causa, gerando diversos tipos de apoios. Porém, as evidências dos casos estudados indicam que a AUP está longe de ter sua perenidade e crescimento assegurados.
creator: Paulo Eduardo Moruzzi Marques, Pierre-Mathieu Le Bel, Vitória Oliveira Pereira de Souza Leão, Roberta Moraes Curan
source: Revista de Economia e Sociologia Rural
publisher: Sociedade Brasileira de Economia e Sociologia Rural
date: 2021
relation: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032021000400206&tlng=pt
coverage: Agriculture (General)

DOS ESPAÇOS PÚBLICOS À NEGOCIAÇÃO INDIVIDUALIZADA: a participação dos agricultores familiares no Projeto Conservador das Águas em Extrema - MG
subject: Agricultura Familiar, Políticas ambientais, Recursos hídricos, participayao social
description: O pagamento por selVi~os ambienlais é um mecanismo para promover a conserva9ao ambiental de caráler volt.mtário, constituindo urna alternativa aos instrumentos regulatórios, No Brasil, o projeto Conservador das Águas em Exlrema/MG constitui urna referencia nacional. Este arligo veicula urna análise dos espat;os públicos associados a este projeto a partir de urna investigayáo sobre a participayáo, considerando a ática dos agricultores beneficiários. Tem como propósito discutir até que ponto a implantayao do mecanismo de PSA-Água acorre de maneira democrática e participativa Identifica o Conselho Municipal de DesenvolvimentoAmbiental e as associayoes de moradores como espayos públicos de participayao construidos em torno deste proJeto, mas que nao foram imprescindiveis á efetiva im plantayao deste dispositivo A negociayao individualizada foi o principal meio para estabelecer contratos privados e assegurar o desenvolvimenlo do projeto. Conclui que, desta maneira, a participayao social alcanyada na gestao deste mecanismo pouco contribui para a construyao de políticas públicas mais democráticas.
creator: Paulo Eduardo Moruzzi Marques, Rafael Eduardo Chiodi
source: Revista de Políticas Públicas
publisher: Universidade Federal do Maranhão
date: 2015
relation: http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=321143695024
coverage: Political science, Political institutions and public administration (General)